Die Integrative Zellbiologie, die Pflanzenbiologie, die Strukturbiologie und die weiße Biotechnologie bilden die Forschungsschwerpunkte im Fachbereich Biologie an der HHU. Die Forschungsschwerpunkte werden durch die Sonderforschungsbereiche SFB590 - Inhärente und adaptive Differenzierungsprozesse und SFB-TR 1 - Endosymbiose: Vom Prokaryoten zum Organell repräsentiert.

Neben den Sonderforschungsbereichen belegen eine Vielzahl von extern, vorwiegend von der DFG geförderten Einzelprojekten, darunter zwei ERC Grants, die exzellente Forschung der Biologie an der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf. Dies zeigt sich auch nach der ersten Vorentscheidung der Exzellenzinitiative. Hier konnten zwei Anträge, an denen der Fachbereich der Biologie maßgeblich beteiligt ist, die erste Hürde des Wettbewerbs nehmen und in die finale Runde der Begutachtung einziehen: CEPLAS und iBrain.

Die überdurchschnittlichen Leistungen in der Forschung wurden auch im Rahmen des "CHE ExcellenceRankings 2010" entsprechend gewürdigt, in dem der Fachbereich der Biologie in die Exzellenzgruppe der besonders forschungsstarken und international orientierten Fachbereiche eingestuft wurde.